Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm6899Q3USS0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm6899Q3USS0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms