Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem253Q3UNB8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem253Q3UNB8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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