Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrch2Q3UMG5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms