Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lmod2Q3UHZ5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmod2Q3UHZ5 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms