Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx27Q3UHD6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms