Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q3U6N9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q3U6N9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q3U6N9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q3U6N9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q3U6N9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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