Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ulk3Q3U3Q1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ulk3Q3U3Q1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ulk3Q3U3Q1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ulk3Q3U3Q1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ulk3Q3U3Q1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ulk3Q3U3Q1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ulk3Q3U3Q1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ulk3Q3U3Q1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ulk3Q3U3Q1 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ulk3Q3U3Q1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ulk3Q3U3Q1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ulk3Q3U3Q1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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