Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LcorlQ3U285 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms