Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U1D9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Q3U1D9 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Q3U1D9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Q3U1D9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Q3U1D9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U1D9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Q3U1D9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U1D9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U1D9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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