Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc174Q3U155 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms