Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms