Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy4Q3TYX8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms