Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TchpQ3TVW5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TchpQ3TVW5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms