Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc136Q3TVA9 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc136Q3TVA9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms