Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Shcbp1lQ3TTP0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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Shcbp1lQ3TTP0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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