Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TTJ4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms