Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gtf3c3Q3TMP1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms