Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim43aQ3TL54 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43aQ3TL54 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms