Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Usp39Q3TIX9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Usp39Q3TIX9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp39Q3TIX9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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