Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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