Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWQ2

Nell1, Protein kinase C-binding protein NELL1, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell1Q2VWQ2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nell1Q2VWQ2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nell1Q2VWQ2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nell1Q2VWQ2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nell1Q2VWQ2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nell1Q2VWQ2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nell1Q2VWQ2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nell1Q2VWQ2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nell1Q2VWQ2 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nell1Q2VWQ2 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nell1Q2VWQ2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nell1Q2VWQ2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nell1Q2VWQ2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nell1Q2VWQ2 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nell1Q2VWQ2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nell1Q2VWQ2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nell1Q2VWQ2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nell1Q2VWQ2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nell1Q2VWQ2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nell1Q2VWQ2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms