Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrp1aQ2LKU9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms