Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHI9

Mcm9, DNA helicase MCM9, mousemouse

Predictions only

Length 1,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcm9Q2KHI9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mcm9Q2KHI9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms