Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd11Q1RNF8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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