Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm1123Q1RME4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms