Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpusd3Q14AI6 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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