Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atp2b3Q0VF55 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms