Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBM2

Fam83b, Protein FAM83B, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83bQ0VBM2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam83bQ0VBM2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam83bQ0VBM2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms