Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL1

Tigd2, Tigger transposable element-derived protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd2Q0VBL1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tigd2Q0VBL1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms