Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
StumQ0VBF8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms