Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spata18Q0P557 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms