Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn2bQ0KL01 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ubxn2bQ0KL01 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ubxn2bQ0KL01 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ubxn2bQ0KL01 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ubxn2bQ0KL01 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms