Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

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Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
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Ttc21bQ0HA38 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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Ttc21bQ0HA38 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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Ttc21bQ0HA38 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ttc21bQ0HA38 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms