Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf541Q0GGX2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf541Q0GGX2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf541Q0GGX2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf541Q0GGX2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf541Q0GGX2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf541Q0GGX2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Znf541Q0GGX2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Znf541Q0GGX2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Znf541Q0GGX2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Znf541Q0GGX2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Znf541Q0GGX2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Znf541Q0GGX2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf541Q0GGX2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms