Protein–RNA interactions for Protein: Q08EJ0

Plac8l1, PLAC8-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plac8l1Q08EJ0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Plac8l1Q08EJ0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms