Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ssrp1Q08943 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssrp1Q08943 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms