Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Cnn1Q08091 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Cnn1Q08091 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Cnn1Q08091 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn1Q08091 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms