Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gdf9Q07105 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdf9Q07105 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms