Protein–RNA interactions for Protein: Q06335

Aplp2, Amyloid-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp2Q06335 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Aplp2Q06335 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Aplp2Q06335 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Aplp2Q06335 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Aplp2Q06335 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Aplp2Q06335 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Aplp2Q06335 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Aplp2Q06335 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Aplp2Q06335 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Aplp2Q06335 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Aplp2Q06335 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Aplp2Q06335 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Aplp2Q06335 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Aplp2Q06335 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Aplp2Q06335 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Aplp2Q06335 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Aplp2Q06335 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Aplp2Q06335 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Aplp2Q06335 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Aplp2Q06335 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Aplp2Q06335 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Aplp2Q06335 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Aplp2Q06335 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Aplp2Q06335 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Aplp2Q06335 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Aplp2Q06335 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Aplp2Q06335 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Aplp2Q06335 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Aplp2Q06335 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Aplp2Q06335 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Aplp2Q06335 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Aplp2Q06335 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Aplp2Q06335 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Aplp2Q06335 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Aplp2Q06335 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Aplp2Q06335 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Aplp2Q06335 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Aplp2Q06335 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Aplp2Q06335 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Aplp2Q06335 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Aplp2Q06335 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Aplp2Q06335 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Aplp2Q06335 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Aplp2Q06335 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Aplp2Q06335 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Aplp2Q06335 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Aplp2Q06335 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Aplp2Q06335 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Aplp2Q06335 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms