Protein–RNA interactions for Protein: Q05793

Hspg2, Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspg2Q05793 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hspg2Q05793 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms