Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox13Q04891 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms