Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs2Q03350 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms