Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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NfiaQ02780 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NfiaQ02780 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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NfiaQ02780 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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