Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms