Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ascl1Q02067 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ascl1Q02067 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms