Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RykQ01887 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RykQ01887 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RykQ01887 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RykQ01887 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RykQ01887 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RykQ01887 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RykQ01887 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RykQ01887 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RykQ01887 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RykQ01887 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RykQ01887 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RykQ01887 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RykQ01887 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RykQ01887 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RykQ01887 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RykQ01887 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RykQ01887 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RykQ01887 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RykQ01887 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RykQ01887 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RykQ01887 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RykQ01887 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
RykQ01887 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
RykQ01887 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
RykQ01887 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
RykQ01887 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RykQ01887 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RykQ01887 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RykQ01887 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RykQ01887 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RykQ01887 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RykQ01887 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RykQ01887 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RykQ01887 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RykQ01887 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RykQ01887 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RykQ01887 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
RykQ01887 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RykQ01887 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RykQ01887 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RykQ01887 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RykQ01887 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RykQ01887 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RykQ01887 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RykQ01887 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
RykQ01887 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
RykQ01887 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RykQ01887 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RykQ01887 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RykQ01887 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RykQ01887 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RykQ01887 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RykQ01887 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RykQ01887 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RykQ01887 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RykQ01887 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RykQ01887 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RykQ01887 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RykQ01887 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RykQ01887 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RykQ01887 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RykQ01887 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RykQ01887 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RykQ01887 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RykQ01887 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RykQ01887 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RykQ01887 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RykQ01887 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RykQ01887 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RykQ01887 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RykQ01887 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RykQ01887 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RykQ01887 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RykQ01887 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RykQ01887 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
RykQ01887 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RykQ01887 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RykQ01887 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
RykQ01887 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RykQ01887 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RykQ01887 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RykQ01887 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RykQ01887 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RykQ01887 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RykQ01887 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RykQ01887 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RykQ01887 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RykQ01887 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RykQ01887 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RykQ01887 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RykQ01887 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
RykQ01887 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RykQ01887 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RykQ01887 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RykQ01887 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms