Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcpQ01853 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcpQ01853 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VcpQ01853 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VcpQ01853 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VcpQ01853 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VcpQ01853 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VcpQ01853 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VcpQ01853 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VcpQ01853 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms