Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mc1rQ01727 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc1rQ01727 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc1rQ01727 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc1rQ01727 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mc1rQ01727 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms