Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sec23aQ01405 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec23aQ01405 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms