Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Top2aQ01320 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top2aQ01320 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms